הרב שמואל נולד בירושלים, למד בישיבת קול תורה ובישיבת ההסדר בשעלבים.
שימש כר"מ בישיבת שבות ישראל באפרת.ובישיבת מקור חיים בירושלים.
כיהן בעבר כרב הקיבוץ הדתי טירת צבי.
בשנת 1993 ייסד את ישיבת מעלה גלבוע עם הרב יהודה גלעד והרב דוד ביגמן, והשלושה עומדים בראשה עד היום.
הרב ריינר נשוי לוורדה, אב לשישה, ומתגורר במצפה נטופה שבגליל התחתון.
